O objetivo desta auditoria foi de conhecer os macroprocessos nas áreas de atuação no MAPA, com o fim de identificar suas formas de operacionalização, os atores envolvidos no processo e os recursos orçamentários destinados à execução da Política Agrícola.

Buscou-se identificar áreas que devem ser objeto de fiscalização pelo Tribunal de Contas da União, levando-se em conta os objetivos, a relevância, os riscos, a concepção lógica, a quantidade de recursos destinados para os programas e as vulnerabilidades que permeiam cada área de atuação do MAPA. Procurou-se também subsidiar o processo de modelagem da Prestação de Contas Anual do MAPA e instituições vinculadas.