La tercera versión del manual, publicado por primera vez en 1998 y revisada en 2000.

Refleja la evolución de los métodos y las técnicas empleadas por el TCU, a través de la acumulación de experiencia en la aplicación de las auditorías de rendimiento. En la preparación del manual se consideran las mejores experiencias internacionales en la materia, así como las contribuciones de los profesionales de este Tribunal. El manual sigue los patrones de auditoría aprobados por la Organización Internacional de las Entidades Fiscalizadoras Superiores - INTOSAI.

Define los principios y normas que orientan la aplicación y control de la calidad de las auditorías sobre las unidades técnicas del tribunal. 

Título original: Manual de auditoria operacional