Em 2014, o TCU realizou auditoria operacional com o objetivo de avaliar a eficácia do Projeto Mais Médicos para o Brasil por meio da verificação das atividades desenvolvidas no período de julho de 2013 a março de 2014. Para a avaliação, foram analisados dados disponíveis em sistemas do Ministério da Saúde e realizados estudos de caso, visando averiguar o atingimento das metas anteriormente definidas, tendo em vista que o projeto se encontrava em fase inicial.