O presente estudo tem como objetivo discutir a necessidade de uma auditoria interna independente, no âmbito do Poder Judiciário da União. Para tanto, discorreu-se sobre o conceito de auditoria, classificação, sua importância para a Administração Pública, seu funcionamento na atividade administrativa, bem como sua atuação nas Linhas de defesa. Tratou-se da importância de uma unidade de auditoria interna independente com cargos públicos efetivos de auditor interno, que contribuirá para o fortalecimento da independência de ambos (unidade e auditor). Nesse sentido, distinguiu-se a independência material ou orgânica da independência formal ou funcional. Teceu-se, também, acerca da importância da independência para a autonomia do auditor. E por fim, citou-se alguns benefícios de uma auditoria interna independente, no âmbito do Judiciário Federal, como também alguns riscos dessa falta de independência.